6月5日，广州市南沙区发布通告称，为配合全员核酸检测工作，自2021年6月5日14时起，自2021年6月5日14时起，全区城市公交、地铁、轮渡、长途客运暂停运营；无特殊原因，市民不要离开，高快速路、高铁、码头等全部离南沙通道暂时关闭，恢复时间另行通告。

6月6日，广州市南沙区再次发布通告，称南沙区内车辆原则上只进不出，并提出如下指导意见：

 一、在南沙港区作业的货车，由广州港集团按照疫情防控工作要求，加强对进入港区车辆司机防疫管理。离开南沙区时，按照“点对点”闭环管理原则，司乘人员须持有72小时内核酸检测阴性证明，且只能通过南沙港快速及与其连接的高速公路进出港区。

二、南沙区（除南沙港区外）的货车，离开南沙区时，司乘人员须除持有72小时内核酸检测阴性证明外，还须出示单位有关证明。

三、除上述车辆外，有防疫任务或特殊情况的单位需离开南沙区的，须提出具体要求，由对口行业主管部门审定后实施分级分类管理，在做好防疫检查后予以放行。

四、小客车除执行第三条外，司乘人员须持有72小时内核酸检测阴性证明。

随后，广州港也发布通告称，为进一步管控港区疫情输入风险，保障各位司机的身体健康，进出南沙港区作业的货车司机，需要执行以下防疫措施：

1、码头所有涉及拖车的预约进港和单证业务，全部通过相应公司网站、微信等线上办理，无须与码头人员接触。

2、司机进入码头前，需扫闸口处场所码，经码头工作人员检查，体温正常、粤康码显示绿码才可进闸。

3、司机进入码头后，需全程戴口罩，严禁司机下车，严禁丢弃物品垃圾等；如装卸过程中遇到特殊情况，电话联系码头中控（见进港证的背面）。

4、货车离开码头后，按照南沙区政府防疫“点对点”闭环管理原则，只能通过南沙港快速路及与其连接的高速公路。

5、目前南沙港区(南沙一二三期集装箱码头，南沙粮食通用码头，南沙汽车码头，南沙港发石化码头，南沙小虎石化码头)，大船班期，驳船，拖车作业一切正常。

如有违反以上规定，码头按违章处理，并报送政府防疫部门处理。